按照《黨和國(guó)家機(jī)構(gòu)改革方案》，黨中央在金融、科技、社會(huì)、港澳方面組建了5個(gè)新機(jī)構(gòu)，其中就包括組建中央港澳工作辦公室。港澳工作機(jī)構(gòu)正式從國(guó)務(wù)院系統(tǒng)轉(zhuǎn)歸黨中央系統(tǒng)。領(lǐng)導(dǎo)體制的改革，將對(duì)港澳工作產(chǎn)生多方面撬動(dòng)。

　　“一國(guó)兩制”已經(jīng)納入國(guó)家治理體系的13項(xiàng)基本制度體系之一，成為治國(guó)理政總體方略的重要組成部分。因應(yīng)港澳工作的新形勢(shì)，2020年中央港澳工作協(xié)調(diào)小組改為中央港澳工作領(lǐng)導(dǎo)小組，從“協(xié)調(diào)”到“領(lǐng)導(dǎo)”，職責(zé)更重要更全面，因而也需要配套強(qiáng)有力的辦事機(jī)構(gòu)。組建中央港澳辦，是加強(qiáng)黨中央對(duì)港澳工作的集中統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)，是以更大力度落實(shí)港澳工作方針的重要組織保障。

　　并且，港澳工作涉及黨、政、軍、群不同領(lǐng)域。就以剛剛閉幕的全國(guó)兩會(huì)來(lái)說(shuō)，不僅全國(guó)人大常委會(huì)、國(guó)務(wù)院、全國(guó)政協(xié)常委會(huì)的工作報(bào)告中，都有不少內(nèi)容涉及港澳，最高法、最高檢工作報(bào)告也同樣多處著墨。如最高法“基本實(shí)現(xiàn)內(nèi)地與港澳民商事司法協(xié)助全覆蓋”，最高檢“堅(jiān)決貫徹香港特別行政區(qū)維護(hù)國(guó)家安全法”等。“一府兩院”均由人大產(chǎn)生并接受監(jiān)督，彼此間則是平行并立關(guān)系。過(guò)往的港澳辦是國(guó)務(wù)院辦事機(jī)構(gòu)，屬于行政機(jī)關(guān)，難以從制度上和法理上統(tǒng)籌其他系統(tǒng)的港澳工作。

　　而黨的領(lǐng)導(dǎo)則是“總攬全局、協(xié)調(diào)各方”，落實(shí)到了國(guó)家治理各領(lǐng)域各方面各環(huán)節(jié)。此次改革，將港澳辦列入黨中央機(jī)構(gòu)序列，在體制上更為優(yōu)化理順，也更具權(quán)威，便于綜合協(xié)調(diào)黨務(wù)、人大、政府、政協(xié)、法院、檢察院以及軍隊(duì)、群眾團(tuán)體等方方面面關(guān)系，加強(qiáng)謀劃，整合資源，形成港澳工作合力。

　　在組建中央港澳工作辦公室之后，還將繼續(xù)保留國(guó)務(wù)院港澳事務(wù)辦公室牌子。這種“一套班子，兩塊牌子”的模式，在部委之中并不鮮見(jiàn)。這便于在不同場(chǎng)合，根據(jù)需要以不同名義開(kāi)展工作?，F(xiàn)行機(jī)構(gòu)中，如“中央臺(tái)灣工作辦公室”與“國(guó)務(wù)院臺(tái)灣事務(wù)辦公室”，“中央保密委員會(huì)辦公室”與“國(guó)家保密局”，均是如此。